En el comienzo del año 1996, la AUF designó por primera vez a los integrantes del Consejo de Fútbol Femenino con la idea de organizar certámenes de la disciplina dentro de la Asociación.
En aquel entonces, Matilde Reisch era la presidenta del Departamento de Fútbol Femenino y luego de muchos meses de trabajo, el martes 23 de julio de 1996, se elaboró el acta fundacional.La dirigente junto con representantes de Basañez, Cerro, Danubio, Liverpool, Nacional, Rampla Jrs y Rentistas,se hicieron presentes en la noche del acta inicial, cuyo objetivo principal era el de realizar la actividad oficial de fútbol salay fútbol 11, las que finalmente comenzaron en el mes de setiembre y octubre, respectivamente.
Otro de los objetivos que fueron planteados y llevados a cabo, fue iniciar con cierta anticipación, al comienzo de la competencia, los fichajes de las jugadoras. El 15 de agosto se dieron los primeros de fichajes de la historia de futbolistas mujeres en la AUF, tal fue el caso de Silvia Álvarez (Rampla Jrs), Soraya Cabrera (Bella Vista), Stella Araujo (Liverpool), Miriam de Cuadros (Rampla Jrs), Silva Castro (Basáñez), Mirta Díaz (Danubio), Alejandra Laborda (Danubio), entre otras.
Cabe señalar que en la primera temporada participaron siete instituciones: Basañez, Bella Vista, Cerro, Danubio, Liverpool, Rampla Juniors y Rentistas.
Campeones Uruguayos de Primera División
1996 – Rampla Jrs
1997 – Nacional
1998 – Rampla Jrs
1999 – Rampla Jrs
2000 – Nacional
2001 – Rampla Jrs
2002 – Rampla Jrs
2003 – Rampla Jrs
2004 – Rampla Jrs
2005 – Rampla Jrs
2006 – Rampla Jrs
2007 – River Plate
2008 – Rampla Jrs
2009 – River Plate
2010 – Nacional
2011-2012 Nacional
2012 – Cerro
2013 – Colón
2014 – Colón
2015 – Colón
2016 – Colón
2017 – Peñarol
2018 – Peñarol
2019 – Peñarol
2020 – Nacional
Presidencias
1996-2002: Prof. Matilde Reisch
2002: Claudia Junowicz
2003-2007: Alda Novell
2007-2008: Jorge Burgell
2008-2009: Alberto Avellaneda
2009-2010: ElbioUslenghi
2010: Laura Vieytes
2010-2015: Prof. Nair Ackermann
2016-actual: Lic. Valentina Prego
